Katô Marika, étudiante de troisième année à l'Académie pour filles de Hakuho, est une pirate de l'espace légitime dotée d'une Lettre de Marque. Entre ses études, son club le "yacht de l'espace", son travail à mi-temps au café, et le fait d'être le capitaine du vaisseau pirate Bentenmaru, les jours de Marika sont très occupés.Un jour, Marika décroche un travail où elle et son équipe doivent piller un vaisseau de luxe, elle découvre grâce à la liste des passagers qu'un garçon nommé Kanata Mugen est sur le vaisseau, cet étrange garçon possède un "passe de la galaxie". Ainsi, une course dans l'hyperespace entre les pirates et le jeune garçon commence..